Faustão é bastante discreto em relação à sua vida pessoal, no entanto, um breve relacionamento com Claudia Raia veio à tona no início dos anos 1990. Os dois não falam publicamente sobre o assunto, mas para revistas da época, ele confirmou o namoro, que começou após ele se separar de Magda Colares. O relacionamento durou pouco e, em 1992, a atriz iniciou namoro com Edson Celulari, com quem se casou no civil em 1993. Juntos, eles tiveram Enzo e Sophia. Em 2010, ele anunciaram o término do casamento e atualmente Claudia é casada com Jarbas Homem de Mello e Edson com Karin Roepke. Já Faustão é casado com Luciana Cardoso, com quem tem dois filhos, Rodrigo e João Guilherme. Ele também é pai de Lara, fruto da relação com Magda. Recentemente, surgiram rumores de que Sophia, filha de Claudia, e João Guilherme, herdeiro de Faustão, estariam namorando.