O diagnóstico do ebola é deito pelo infectologista ou clínico geral, no hospital, através da avaliação dos sintomas, histórico de contato com animais ou pessoas infectadas, ou viagem para locais endêmicos.
Além disso, o médico deve solicitar exames, como hemograma completo, coagulograma, painel metabólico, gasometria arterial, creatinofosfoquinase, exames de urina e raio X de tórax, por exemplo. Outro exame que pode ser solicitado é o RT-PCR para identificar o vírus Ebola no organismo.