Um dos maiores cuidados envolvendo o clonazepam é seu potencial de causar dependência. Com o passar do tempo, o organismo pode desenvolver tolerância ao medicamento, fazendo com que sejam necessárias doses maiores para alcançar o mesmo efeito.
Além da dependência física, muitas pessoas desenvolvem dependência psicológica, acreditando que só conseguem dormir ou controlar a ansiedade se utilizarem o medicamento diariamente.
O uso contínuo também pode provocar prejuízos cognitivos, como dificuldades relacionadas à memória recente, atenção e velocidade de raciocínio, principalmente entre pessoas idosas.