Na gestão dos negócios, destacou-se também seu filho: Blairo Maggi, que, além de ser um dos acionistas da empresa, foi governador de Mato Grosso por dois mandatos (2003 e 2007), senador e ministro da Agricultura no governo Michel Temer. O prestígio no agronegócio fez com que Blairo ficasse conhecido como “rei da soja” e fosse considerado pela Forbes uma das pessoas mais influentes do mundo. Fez também com que virasse alvo de críticas de várias entidades ambientais.