Thomas Müller também soma 13 títulos da Bundesliga com o Bayern de Munique, igualando o recorde de Giggs em número de ligas nas Top-5. Revelado pelo próprio Bayern, ele estreou na equipe principal na temporada 2008/09 e rapidamente assumiu protagonismo.
A partir de 2009/10, tornou-se peça fundamental do time alemão. Atuando como meia-atacante e segundo atacante, destacou-se pela inteligência tática, movimentação e capacidade de decidir jogos importantes. Participou de ciclos dominantes do Bayern, incluindo temporadas com campanhas quase perfeitas na liga.
Sua valorização ocorreu pela regularidade e influência em títulos consecutivos. Müller integrou elencos multicampeões que dominaram o futebol alemão por mais de uma década, além de ter papel relevante nas conquistas europeias do clube.