A crononutrição também levanta dúvidas sobre a existência de horários específicos para cada nutriente. Não há, porém, uma regra geral segundo a qual carboidratos devem ser consumidos apenas durante o dia ou proteínas exclusivamente à noite.
O organismo apresenta mudanças circadianas na utilização dos nutrientes, mas isso não significa que determinados alimentos deixem de fazer parte de uma alimentação saudável depois de certo horário.
Para o controle do peso, a qualidade da dieta, a quantidade total consumida e a regularidade da rotina continuam sendo fatores importantes. A distribuição das refeições deve considerar também as necessidades e a realidade de cada pessoa.
Uma refeição mais próxima do horário de dormir pode ser especialmente desconfortável quando é muito volumosa ou rica em gordura. Quando houver necessidade de comer nesse período, preparações menores e mais leves podem ser uma alternativa.