Outro risco está na combinação de suplementos com medicamentos. Dependendo da substância utilizada, pode haver interferência na absorção ou no efeito de determinados remédios. A mistura de diferentes suplementos também merece atenção, já que alguns produtos apresentam nutrientes em suas fórmulas que podem se repetir. Dessa forma, a pessoa pode ultrapassar os limites recomendados sem perceber.
Um levantamento publicado no periódico científico New England Journal of Medicine analisou atendimentos em serviços de emergência nos Estados Unidos entre 2004 e 2013. A pesquisa estimou aproximadamente 23 mil atendimentos por ano relacionados a efeitos adversos de suplementos alimentares, além de cerca de 2,1 mil hospitalizações anuais.